La principale application de ces filtres à membrane est la filtration d'air, de gaz ou de produits chimiques. Elles sont fabriquées en PTFE (polytétra-fluorethylène) uniquement et sont donc hydrophobes en permanence. Contrairement aux autres types de filtres (hydrophiles), ils ne sont pas humidifiés par l'humidité de l'air, ce qui permet également un passage sans entrave de l'air à basse pression différentielle. Les filtres à membrane PTFE ont une excellente compatibilité chimique (pH 1-14), de sorte qu'ils sont également utilisés pour la filtration des solvants et des acides, auxquels les autres types de filtres ne sont pas résistants. En raison de leurs caractéristiques hydrophobes, ils doivent être pré-humidifiés avec de l'éthanol ou du méthanol avant la filtration des milieux aqueux.