Collectivement, les vecteurs pGEX fournissent les trois cadres de lecture translationnelle à partir d'un site de restriction EcoRI. Certains vecteurs disposent d'un site étendu de clonage multiple (MCS) qui contient six sites de restriction. Le MCS élargi facilite le clonage unidirectionnel des insertions cDNA provenant de bibliothèques construites à l'aide de nombreux vecteurs lambda disponibles. pGEX-6P-1, pGEX-6P-2 et pGEX-6P-3 codent chacun la séquence de reconnaissance pour le cleavage spécifique au site par protéase PreScission, (voir PreScission Protease) entre le domaine GST et le site de clonage multiple . pGEX - 4T-2, et pGEX- 4T - 3 sont dérivés de pGEX-2T et contiennent un site de reconnaissance Thrombin.

Un promoteur tac pourl'expression chimiquement inducible de haut niveau de protéines récombinantes étiquetées GST

Un gène lacIq interne à utiliser dans n'importe quel hôte E. coli

Conditions d'élution très modérées pour la libération de protéines de fusion à partir de la matrice d'affinité, minimisant ainsi les effets sur l'antigénicité et l'activité fonctionnelle

Sites de reconnaissance de protéase PreScission, Thrombin ou facteur Xa pour le nettoyage de la protéine souhaitée du produit de fusion